1.选用抗性品种。选用抗病的双孢蘑菇品种可显著减少病害的发生，从而做到不用药或少用药。
2.菇房设施和布局要合理。一次发酵料场和（二、三次）发酵隧道不能与菇房设置在同一区域。覆土车间要远离栽培区域。菇房墙面光洁、地面平整但要略有坡度，以便于清洁、防止积水。菇房要密闭性好，栽培期的菇房处于正压状态，进气口和出气口应都设有初效过滤（网眼5微米）。排水沟能直接排出污水，并能与外界隔绝。
3.做好菇房及环境卫生与消毒工作。保持菇房及其周围环境的清洁卫生是病害安全防控的前提与基础。菇房内及菇房四周要做到无积水、无杂菌、无滋生虫害的垃圾，栽培废料应撤到远离菇房的地方作肥料或深埋。
4.采用清洁覆土。覆土是双孢蘑菇栽培的重要基质，也是病虫害的主要传播源，其关键控制点是营养成分、清洁度、含水量、持水性以及持水性的可逆度等。覆土材料需在洁净的地方储存，防灰尘、防阳光暴晒、防高温，覆土材料的储存库必须与栽培场分开，避免交叉感染。拌土用60℃的水，对杀死蛛网病菌丝有帮助。
5.加强管理，合理调节菇房的温、湿、气。覆土以后，要处理好营养生长和生殖生长期间温度、湿度、空气三者的关系。要防止菇房长时间处在高湿的环境，这是预防蛛网病发生的有效手段。
6.化学防治。在覆土调水的最后一次，将施保功50%可湿性粉剂每克兑水1千克（稀泽500～600倍）喷在覆土上，用量在0.5～0.75千克/每平方米。
